病情严重者可能遗留癫痫及认知功能障碍等。脑炎全身毒血症状有发热、头痛、身痛、恶心、呕吐、乏力。少数有出血疹及心肌炎表现。
神经系统症状表现为意识障碍，脑膜刺激征。可出现颈肌及肩胛肌弛缓性瘫痪，以致头下垂及手臂不能上举，摇摇无依。脑神经及下肢受累少见。
瘫痪2～3周可恢复，约半数肌肉萎缩。轻症可无明显神经症状。