头顶痛的原因比较多。头皮肌紧张造成的头皮肌肉疼痛，称为肌收缩性头疼，也叫肌紧张性头疼。由于头皮肌肉的收缩，酸性代谢产物堆积，刺激疼痛敏感结构造成头痛。
还有一种神经痛，从两侧颈部或者枕部发出的神经到达头顶部，其末梢出现任何原因的刺激，造成烧灼样的、撕裂样的、针刺样的疼痛，这样的头痛叫做神经痛。
如果是一跳一跳的、节奏非常明显的头痛，属于血管性头痛。