小儿泌尿系统感染治疗分为一般治疗和抗感染治疗。前者在急性期卧床休息，多饮水，多排尿，饮食易消化，含足够热能和蛋白质，同时应注意外阴部干燥清洁卫生，必要时可根据患儿年龄、尿感的定位诊断及病原，在医生指导下选择合适的抗生素进行治疗。
注意，小儿时期反复感染者多伴有泌尿系结构异常，应认真查找原因，解除先天性梗阻，防止肾损害及瘢痕形成。