巧克力囊肿是属于子宫内膜异位症的一种，这种疾病是需要系统的，而子宫内膜异位症是可能导致不孕的，疾病的前期叫做，子宫内膜异位症。
疾病的病因现在并没有明确。主要是自身内分泌激素和性生活引起，比如月经期间性生活，可能有点影响的。巧克力卵巢囊肿属广义上的卵巢肿瘤的一种，各种年龄均可患病，但以20—50岁的女性最为多见。
卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，恶性变的程度很高。