男性不育症的症状，取决于导致不育原因的原发病的症状。比如对于精索静脉曲张，可以有阴囊区的胀痛不适，严重者可以在阴囊上方触及曲张的团块。
而对于睾丸附睾炎后痊愈的不育，其一般可以在睾丸扪及一些凹凸不平的炎性结节，一般没有明显的症状。对于雄性激素过低的不育症，可能表现为阴茎勃起功能障碍、性欲低下等。