小女孩月经不调的原因是内分泌因素引起的，常见的引起月经不调的因素是卵巢性腺轴的紊乱，在青春期卵巢的负反馈与下丘脑垂体没有形成良好的调节时，多数会形成青春期功血，月经周期是根据卵巢的排卵周期而形成的，如果卵巢没有周期的排卵，就不会形成规律的月经，一般是排卵后两周来月经，所以排卵提前的月经就会提前，排卵推迟的就会月经推迟，对于无排卵的，一般会月经推迟或者是不来，或者是异常出血。