睾丸小也有生理性和病理性。生理性的睾丸小，只要是能够制造出足量的正常精子，不会影响生育。病理性睾丸，常见的有慢性消耗性疾病、内分泌障碍、持续高热、服用大量雌性激素、病毒性睾丸炎、睾丸梅毒等。
可使睾丸眼萎缩，以至于体积小于正常。病理性的睾丸萎缩变小，往往伴有不育症；但是，因为具有分泌雄激素的间质细胞较少累及，所以一般不影响男性生殖器官和男性副特征的发育，睾丸严重萎缩以致发生不育症者并不多见。