停经三个月以内，胚胎停育的话，可以选择药物流产的，因为药物流产，相对于人工流产来讲，损伤还是比较小的。但是如果药物流产失败的话，最终还需要选择人工流产。
胚胎停止发育，滞留宫腔太久，一方面组织机化，增加清宫困难，容易继发感染；另一方面会分泌毒素影响身体的凝血功能，严重时可以导致大出血，甚至造成孕产妇的死亡。