肛周脓肿手术的步骤，第一步是摆体位，根据病人肛周脓肿的具体位置，比如左侧或右侧，选择合适的卧位，方便手术操作。第二步是麻醉，肛周脓肿下可以在局麻下完成，做好充分的麻醉，可以使手术时，病人不感觉到疼痛。
第三是消毒，采用碘伏消毒液，清洗肛门周围、会阴部及直肠黏膜。第四步是手术，切开脓肿表面波动感最强的部位，清除脓腔坏死物，做好充分引流，完成手术。