阴茎流脓跟急性尿道炎有一定关系。急性尿道炎一般分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎，非淋性尿道炎的致病菌是支原体衣原体。
这两种疾病的临床症状是相似的，所以需要根据检查结果来进行鉴别诊断，可以去做一个尿常规，分泌物涂片检查和分泌物培养检查来寻找到致病菌。
然后根据检查结果来选择敏感的抗生素来进行治疗。