桥本甲状腺炎如甲状腺功能正常，无需特殊治疗，需要随诊。甲状腺功能减低应行甲状腺激素替代治疗，选用甲状腺相关的药物，直至维持量，达到维持剂量的指标是临床症状改善，TT3、FT3、TT4、FT4、TSH正常。
对一些疼痛性慢性甲状腺炎甲状腺疼痛、肿大明显时，可加用泼尼松，好转后逐渐减量，用药1～2个月。