睾丸炎的治疗，要根据病因做相应的治疗。最常见的细菌性睾丸炎，要用抗菌素。根据病原体，选用有效的抗菌素。对于细菌性的睾丸炎，用这些抗菌药物都是有效的。
如果是发生在腮腺炎感染以后出现的急性睾丸炎，应用抗菌素是无效的。因为腮腺炎以后，病毒感染导致体内免疫性反应。免疫抗体可以作用于睾丸，引起睾丸炎症。
这个时候是无菌性的炎症，主要是使用药物治疗。其他的创伤性以及结核性的睾丸炎，根据病因做相应的治疗。