肝内胆管结石和十二指肠溃疡症状不一样，肝内胆管结石病人的主要症状是右上腹部不适甚至胀痛，炎症感染或是堵塞时会出现腹痛呕吐发热和黄疸尿黄等症状。
十二指肠溃疡主要临床表现为上腹部疼痛，可为钝痛、灼痛、胀痛或剧痛，也可表现为仅在饥饿时隐痛不适。典型者表现为轻度或中度剑突下持续性疼痛，可被制酸剂或进食缓解。