引起龟头发炎的原因比较多，可能是不注意个人卫生，性生活没有注意卫生以及不洁的性交方式引起的。长期过度的手淫，如果手法粗暴，而且没有注意手部卫生时，也是引发龟头炎的一个常见因素。
男性如果患有包皮过长，或者是包茎时，因为长期有包皮垢的残留，没有注意清洗时，也会引起龟头炎。如果是滴虫性龟头炎、霉菌性龟头炎，这通常是性伴侣之间发生的交叉感染。