肛门疼痛的治疗上，首先要从肛门疼痛病根上出发，要找到肛门疼痛的病因是什么，这样对肛门疼痛的治疗才是有帮助的，同时也肛门疼痛要考虑到一些肛门疼痛的特殊性，通过检查之后再具体决定治疗方式。
肛门疼痛的疾病一定要重视治疗的工作，保持清淡为主的饮食，因为可能是由于痔疮的原因导致的肛门疼痛，或者是由于肛裂的疾病，都是可能会出现肛门疼痛的症状的。