卵巢囊肿多为良性肿瘤。是生育年龄妇女最常见的卵巢瘤样病变，有部分是生理性囊肿，如黄体囊肿。<5㎝者可予观察下2一3个月后于月经第5一6天B超复查，可不作特殊处理而自行消失。
若囊肿持续存在或继续增大，则卵巢肿瘤的可能性较大。常见的卵巢囊肿还有输卵管卵巢炎性包块，以抗炎治疗定期复查为主。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，常伴有渐进性的经期下腹痛，还有常见的成熟性畸胎瘤等。