急性扁桃体病人主要是由葡萄球菌和肺炎球菌感染导致，有些病人是由于厌氧菌感染导致，还有是因为某些抵抗力降低，使细菌病毒入侵到扁桃体，诱发扁桃体炎。
细菌病毒的入侵，特别是细菌入侵诱发扁桃体炎是最常见，致病菌最常见的是链球菌。季节的因素，扁桃体炎的诱发和季节有一定关系，比如换季，气温起伏过大，导致自身免疫力出现异常，诱发扁桃体炎。