疱疹性咽峡炎和手足口病病原一致,都是由肠道病毒引起的急性疾病.尽管两者都为可自行恢复的疾病,致病因一致,但两者引发重症的几率却差别很大.手足口重症可引发脑干脑炎,心肌炎,神经源性肺水肿的汹涌病情,死亡率很高.临床上还观察到,手足口病引发患儿抽风等神经系统症状的案例较多,而单纯的疱疹性咽峡炎,如果没有合并细菌感染,则引起抽风等重症症状的几率要低很多.由于这两种疾病都属于病毒感染,目前还没有特异,高效的抗病毒药物可治疗。