如果已经进行CT或核磁共振检查来确定腔隙性脑梗死的发生以及一系列症状，如头晕和恶心，可以选择药物进行治疗。药物治疗主要着眼于改善微循环，因此改善微循环的药物可以用于治疗。
其次，症状消失后，需要口服药物来预防脑梗死的发展。如果血脂相对较高，建议可以使用降脂药物。如果血压高，抗高血压药物可以用来防止疾病再次发展。