流产的最主要原因就是胚胎或者胎儿的染色体发育不正常，这个除了和遗传有关以外，还和药物或者感染等因素有关。流产的原因还有母亲的因素，比如全身的急性或者慢性疾病，生殖器官发育不正常，内分泌失调，或者不良的习惯，免疫功能低下等。
父亲的因素包括精子的染色体发育异常。再就是环境的因素，包括过多的接触放射线或者化学物质。