刺菜可用于热毒疮肿，可内服或外敷。由于刺菜的清热解毒作用，可以用来治疗病毒性肝炎以及肾炎等疾病。刺菜还有利胆和降低血中胆固醇的作用，可用来治疗胆囊炎和动脉硬化，还具有凉血止血，解毒消痈的功效。
刺菜中药学名叫做小蓟。性味甘、凉。入心、肝经。在临床中，刺菜可以治疗尿血、咯血、衄血和崩漏等出血的热证。刺菜特别长于治疗尿血，可以和蒲黄、木通、滑石等配伍治疗使用。
可以大剂量单用熬水喝。