苦杏仁有止咳平喘、润肠通便、杀虫的作用。可以治疗各种咳喘，是治疗咳喘的首选药。还可以治疗肠燥便秘，可以配伍柏子仁、郁李仁一同使用。
除此之外还能治疗蛲虫病以及外阴瘙痒等。苦杏仁性微温、味苦，有小毒，归肺经和大肠经。阴虚咳喘患者以及大便溏泻患者忌用。
煎汤内服用量在3g-10g之间，建议打碎后煎煮，利于有效成分析出。