月经来了头疼，首先是由于经前综合症所引起的。经前综合症是指反复在黄体期出现的周期性的，以情感、行为和躯体障碍为特征的综合症。
月经来潮以后，症状会逐渐的消失。经前综合症的主要的因素可能与精神社会因素、卵巢的激素失调以及神经地质异常有关。其次，雌孕激素比例的失调是经前综合症的常见的原因。
经前综合症患者在黄体后期循环中的类阿片肽浓度异常降低，会出现一些精神神经的症状。包括有头疼、潮热等等的临床表现。
最后，经前期综合症患者对于安慰剂的治疗的反应率较高。部分患者精神症状突出，并且情绪紧张的时候，常使原有症状加重。