婴儿乳糖不耐受的症状为大多数乳糖不耐受患儿的主要表现是肚子胀肠鸣、音亢进、腹泻、恶心呕吐、肠绞痛等胃肠道症状，患儿常常表现出黄色稀便，呈蛋花汤样，还伴有酸臭味和泡沫，有奶瓣。
此外，患儿还容易经常哭闹不安。如果症状没有得到及时有效缓解，随着时间延长，患儿的生长发育会受到影响。不同的患儿其临床表现各有差异。