男性尿路感染的治疗，根据病情，可以选择口服抗菌素和静脉用抗菌素治疗，疗程一般5-7天，病情严重的10-15天。也可以选用一些口服中成药配合治疗。
还要判明是一般的感染或是特殊尿路感染。尿路感染应用抗生素，用抗菌素前要常规行细菌培养、药敏检测，根据药敏选择应用抗菌素。
没有药敏检测的，临床经验可以选择头孢类二代或三代，或喹诺酮类等药物。治疗期间要适当多饮水，注意休息，避免性生活，避免辛辣刺激食物，定期复查。