肠胃炎的治疗是可以使用抗生素及质子泵抑制剂、铋剂等药物，治疗慢性胃炎存在幽门螺杆菌感染的患者。如不存在幽门螺杆菌感染，也可以使用胃黏膜保护剂和中药进行治疗，还要忌烟酒，刺激性食物，养成良好的生活、饮食习惯。
还可以使用抗生素治疗，如免疫抑制剂、氨基水杨酸制剂等中医治疗也会有很好的效果，适用于慢性肠炎是细菌感染引起的肠炎。
对上述药物过敏者及孕妇慎用，建议去医院及时检查，在专科医生指导下进行治疗。