面瘫针灸后脸疼的原因有很多，主要与针灸本身和疾病发展有关。针灸本身就是针刺入皮肤，就会有疼痛感，就像打针一样，注射完局部会有疼痛感，针灸之后面部疼痛一般会发生在针灸治疗的初期，一旦人体适应了这个刺激，就不会感受到疼痛。
面瘫可以分为初期、恢复期、后遗症期等多个阶段。初期疾病可能还处于往严重程度发展的时候，面部本身就有僵硬、麻木、疼痛的感觉，与针灸没有关系，针灸之后疼痛还没有缓解。
这种疼痛是暂时的，会随着病情好转而消失。如出现其他异常情况，建议及时去医院检查治疗。