通常面瘫针灸后耳根后疼可能是因为针灸刺激性过强引起的，建议在专业的医师指导下使用针灸治疗。还可能是在治疗的过程中，针刺破了血管，导致了皮下出血、淤青等情况，过一段时间后会自行痊愈。
还可能是在进行针灸治疗时，情绪比较紧张，引起的耳根后疼，导致针刺后出现滞针状态，热敷后疼痛会得到缓解。人体的穴位分布比较复杂，建议需要在专业的医师操作下进行针灸。