脑积水有可能会脑萎缩。因为脑积水会引起颅内压增高。而大脑在高颅压的压迫之下就会逐步的发生萎缩。如果有脑积水会引起脑脊液的循环发生障碍，所以没有办法运输营养物质，细胞因为缺乏营养以及代谢障碍从而也会引起萎缩。
脑萎缩一般是不可逆的改变，患者会出现不同程度的神经功能障碍的表现，所以发生脑积水初级就要积极治疗，防止并发症产生。