我国大多数新冠疫苗属于灭活病毒，在人体内的结局是被免疫系统杀死，没有像食物，药物一样的排泄途径。新冠灭活疫苗在人体的免疫过程为：首先利用培养基培养新冠病毒，之后用热或化学物质(通常是福尔马林)使之灭活制成。
由于疫苗不是活的，它不会在受种者体内复制，比较安全。当免疫系统发现病毒后，活化的T淋巴细胞会通过分泌穿孔素和颗粒酶来杀死病毒。
接种第一剂次灭活疫苗不会产生保护性免疫力，仅"启动”了免疫系统。保护性免疫力在随后的多剂接种后产生，与可产生近似自然感染免疫应答的活疫苗不同，灭活疫苗产生的免疫应答多数是体液免疫，没有或很少是细胞免疫。
灭活抗原的抗体滴度随着时间而衰减。因此，一些灭活疫苗可能需要定期接种补充剂次，以增加或"加强”抗体滴度。因此疫苗在接种后，激活免疫系统，就会被杀死。
不会有排泄过程。