用于治疗肛周湿疹的药包括抗糖皮质激素、组胺药、抗生素、外用药等，没有所谓最好的药，遵医嘱用药是最好的。
1.糖皮质激素：可以用地塞米松、泼尼松、氢化可的松等糖皮质激素类的药物治疗，能够有消炎、止痒、减少渗出的功效。
2.抗组胺药：用西替利嗪、氯雷他定等抗组胺类的药物治疗，可以改善夜间瘙痒的症状。
3.抗生素：肛周湿疹合并感染时，可以用头孢等抗生素治疗。
4.外用药：对于出现慢性、亚急性的肛周湿疹的患者，可以用氧化锌糊、他克莫司乳膏涂在局部治疗。以上药物使用时谨遵医嘱，治疗期间要保持肛周清洁，不能用手挠抓，最好穿宽松棉质的内裤，忌辛辣，尽量防止腹泻或者便秘。