牙痛大多数是由于口腔内的厌氧菌或沉积在牙齿表面的氧杆菌感染导致。一般牙髓坏死或神经感染都是以专性的厌氧菌感染为主，通常是混合性，常见的有普氏菌、梭形杆菌、消化链球菌、放线菌以及普林单胞菌等，杆菌有乳杆菌、放线杆菌、革兰氏阴性杆菌等。
这些菌都可能与炎症肿胀，甚至与瘘管的形成有一定关系，如果形成牙龈卟啉单胞菌或普氏菌时，可能会引起根尖炎症、软组织的发炎现象概率。
还可能会造成牙齿的持续性的破坏，一旦牙齿疼痛、感染时，建议及时到正规医院采取对应的治疗，以免错过最佳时期。