核酸检测CT值是指：通过RT-PCR技术实时监测反应管中荧光经历多少循环数达到预定的阈值。通过加入荧光基团，使得核酸复制转录形成新的DNA链中含有荧光标记，就可以记录荧光数量判断病毒核酸浓度。
病毒核酸浓度越高，荧光强度越高，循环阈值CT越小。PCR反应过程约70~80分钟。检测样本Ct值小于等于30，且曲线有明显的指数增长期，测定结果有效，可直接报告样本阳性。
Ct值大于30且小于40时，重复一次，如果Ct值仍小于40，且曲线有明显的指数增长期，可报告样本阳性，否则报告样本阴性。