甲硝唑凝胶对黑头的治疗效果不好。黑头粉刺属于痤疮的一种皮损类型，主要是由于毛囊皮脂腺上段开口角化狭窄，皮脂内容物分泌较多，不能顺畅排出，堵塞在毛囊口内，局部被氧化发黑形成黑头。
治疗黑头主要是采用一些调节毛囊角化和抑制皮脂分泌的药物，比较常用的就是维A酸制剂，比如阿达帕林凝胶等。甲硝唑主要是针对螨虫感染有效，是属于一种抗厌氧菌、抗原虫、抗螨虫的抗菌素，对于一些炎症性的痤疮皮损是有不错的效果的，但是由于它并不能够调节毛囊角化开口和抑制皮脂分泌，所以对黑头的治疗效果通常并不明显，所以总的来讲，甲硝唑凝胶治疗黑头是没有明显效果的。