反流性食管炎的治疗方法有生活饮食方式调整、内科治疗、外科以及微创手术治疗等都是治疗反流性食管炎的方法。生活饮食方式调整是通过基本的饮食生活方式的调整来治疗疾病，要求患者控制体重，减少饮食，减少烟、酒、辛辣刺激性食物。
内科治疗主要是药物的治疗，抑酸稍微弱如H2受体阻滞剂；黏膜保护剂包括食管黏膜以及胃黏膜的保护，有混悬液如铝镁加混悬液，还有口服的如替普瑞酮、普瑞博思、达喜；
动力障碍的可使用动力的药物，如吗丁啉、普瑞博思。外科手术以及微创治疗是部分患者内科治疗效果不好并排除其他的恶性疾病以及自身免疫类疾病后，可进行胃折叠术或射频消融术。