服用甲状腺功能亢进药物的副作用如下：
1、抑制血液系统：导致白细胞和中性粒细胞数量减少甚至缺乏，使人体难以抵御细菌入侵，容易发生感染。
2、对肝功能的影响：甲巯咪唑容易影响胆红素代谢，丙基硫氧嘧啶容易导致转氨酶增高。
3、过敏反应：甲巯咪唑类药物比较容易出现荨麻疹，但这种过敏反应属于迟发性，在服药2-4周时才会出现。
4、血管炎：丙基硫氧嘧啶容易引发相关性血管炎，会出现咯血或血尿等表现。出现不适请及时就医，具体用药谨遵医嘱。