核酸检测可以查出艾滋，但只能检测处于窗口期的艾滋病且适用于早期的筛查。艾滋病的窗口期是指艾滋病患者感染病毒以后4-8周的时间内。
HIV核酸检测是艾滋病检测的重要项目之一，HIV核酸定量检测和cd4+t淋巴细胞计数是判断疾病进展、指导临床用药、评估疗效和预后的重要指标。
核酸检测是检测RNA或DNA等遗传物质，不仅用于艾滋病的检测，其他一些病毒感染如甲型流感、丙型肝炎等病毒感染也可以用这种检测方法确诊，用于指导临床诊疗工作。