甲亢眼突是自身免疫性的疾病，往往临床治疗效果差，完全治愈的可能性小，且治疗效果与患者病情有关。甲亢眼突分为良性眼突和恶性眼突，良性眼突可得到控制，恶性眼突病情往往很难控制。
良性眼突，通常由于血液内的甲状腺激素水平升高，交感神经兴奋，可使患者眼裂增宽，眼球轻度突出，临床上积极的控制甲亢达标，患者的凸眼可以逐渐缓解。
恶性眼突，由于患者体内自身免疫性物质，可刺激眶后组织细胞纤维化增生，可致突眼加重，伴有球结膜的充血、水肿、视物模糊、眼痛、视神经压迫等症状。