先天性甲低婴儿表现为三落后，生长发育延迟、生理功能低下、智能落后。生长发育落后表现为过期产、前后囟大、身材矮小、躯干长、四肢短小、上部量比下部量大1.5cm。
坐、站、走明显落后于同龄儿，还有声音嘶哑、学话困难、性发育落后、肌张力低下。生理功能低下的表现，新生儿期表现为少哭、嗜睡、低温、四肢凉、生理性黄疸延迟、半岁内出现精神差、安静、少动、对周围事物反应差、嗜睡、纳呆、声音低哑、怕冷。
排便排出延迟、肠蠕动慢、腹胀、难治性便秘、脉搏和呼吸缓慢、心音低钝。智能落后的表现，表情淡漠、呆板，翻身、坐立、走的时间明显迟钝，常伴有听力减退、感觉迟钝，智商通常小于70。