艾灸时间的长短因人而异。一般在40分钟到2个小时之间不等。艾灸时间不能过短，否则药力没办法渗透，治疗效果不理想，一般不能低于30分钟。
但是有些特殊部位，例如脸部周围的穴位，可以艾灸20分钟左右。艾灸时间也不能太长，一般不超过2小时。在艾灸的治疗中，应保持饮食均衡，做好保暖，使得艾灸的效果发挥最大。