妊娠期甲状腺疾病患者需要对症用药治疗，用药谨遵医嘱。如果合并原发性甲状腺功功能亢进，若是合并甲状腺功能亢进，要采取抗甲状腺药物治疗。
如果甲亢不得到有效控制，可能会造成早产、流产、死胎的情况。一般会采取丙基硫氧嘧啶进行治疗，这个药物通过胎盘的量非常少，对胎儿不会造成太大影响。
妊娠合并甲状腺功能减退，如果甲状腺功能减退不治疗，将来生出的孩子可能就是痴呆儿，智力发育受到影响。甲状腺功能减退一般会采取优甲乐替代治疗，这个药物对胎儿发育没有影响，是比较安全的。
无论是合并甲亢或甲减，在孕期每个月都要复查甲状腺激素水平，然后到专门的分泌科就诊，在医生的指导下，调整相关药物用量。