艾灸关元穴最好在上午9-11点之间，因为上午阳气比较旺盛。艾灸关元穴对于女性月经不调、痛经等有一定的效果。对腹部冷痛，手脚冰凉体质的患者可艾灸此穴，可起到很好的缓解作用。
另外，灸关元还能够治疗男科的疾病，比如遗精、阳痿、早泄等疾病。不过需注意艾灸关元要注意小心烫伤，当身体出现任何不适时应及时就医，并由专业中医进行操作。