小男孩生殖器清洗的方法如下：
1、清洗男宝宝外生殖器的水，温度应控制在40℃以内，以免烫伤宝宝娇嫩的皮肤。
2、清洗时，手法要轻，要稳，用力和缓，这样会避免因为一时紧张而用力挤压或捏到宝宝的外生殖器，包括阴茎和阴囊。
3、轻轻抬起宝宝的阴茎，用一块柔软的纱布轻柔地蘸洗根部。阴囊下边也是汗液和污垢容易隐蔽的地方，包括腹股沟的附近，要着重擦拭。 如果发现孩子生殖器出现异常，建议及时就医，规范治疗。