乙肝小三阳一般是很难自愈的。当机体被乙肝病毒感染后，很难将病毒完全清除，这时会转为慢性感染的状态。如果是成人急性感染乙肝病毒，化验结果为乙肝大三阳的情况下，自身的免疫系统是可以清除病毒的，会达到临床自愈的效果。
但如果病毒持续高水平复制，对肝脏造成持续的损伤，则需要长期应用抗病毒药物来抑制乙肝病毒复制。当患有乙肝小三阳时，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。