手指甲盖凹凸不平的原因有很多，具体详情如下。首先可能是患者本身存在着银屑病、湿疹皮炎、掌跖脓疱病、连续性肢端皮炎等皮肤病，这种情况是会引起指甲凹凸不平的。
其次缺铁性贫血也是会导致甲板凹凸不平的。另外甲营养不良，有肠寄生虫病或肠道功能异常，外伤损伤指甲，真菌感染等都会出现手指甲盖凹凸不平的情况。
当手指甲盖凹凸不平时，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。