六君子丸和香砂六君子丸的区别主要有以下两方面：
1.功能主治。六君子丸主要补益脾胃之气，改善脾胃虚弱，食量不多，气虚痰多，腹胀腹泻等症；而香砂六君子适用于脾胃气虚，寒湿停滞中焦所致纳呆，嗳气食少，脘腹胀满或疼痛等症。
2.组成成分。六君子丸是由党参、麸炒白术、茯苓、姜半夏、陈皮、炙甘草这六味药组成；而香砂六君子丸则是在六君子丸的基础上加入了木香、砂仁。 由于用药具有专业性，上述药物的服用需在医生的指导下辨证服用，不可私自乱用药物，以免出现不良反应。