牡丹花蕊茶具有活血调经、镇痛、美容养颜、促进消化的功效。牡丹花蕊茶是牡丹精华部位，产量稀少，富含氨基酸、活性多糖、黄酮类化合物等成分，具有滋阴补肾的功能，可以预防和缓解严重偏头痛，促进血液循环。
牡丹花蕊茶性寒，脾胃虚寒者不宜饮用，以免加重虚寒症状。建议牡丹花蕊茶喝完后，产生不适的患者，及时就医，以免延误治疗。