肛瘘患者不想开刀，可以通过改善自身的饮食、排便习惯，并且注意肛门局部的清洁卫生，防止肛瘘出现急性感染。还可使用高锰酸钾溶液进行坐浴，同时可使用红霉素软膏等药物局部外涂，起到消炎的作用。
此外还可以口服头孢克肟、头孢克洛等抗生素的药物进行抗炎治疗。肛瘘主要是由于肛隐窝感染发炎进而诱发肛周脓肿，肛周脓肿破溃之后形成肛瘘。
多数的肛瘘患者还是需要采取手术进行治疗，若不通过手术及时清除干净内肛以及瘘管，会导致肛瘘越来越严重。所以建议患者应及时就医，并由医生根据个人情况选择合适的方式进行治疗，以上药物应遵医嘱使用，切勿盲目使用，以免不对症耽误治疗。