心脏神经官能症患者都有焦虑或抑郁的情绪，选择药物的时候要用一些精神类、抗焦虑或抗抑郁的药物如黛力新、丁螺环酮、奥氮平等。
有些人还有失眠多梦的症状，可以用阿普唑仑、地西泮等安神药物。有些病人感觉到心悸、心慌，可以用倍他乐克、比索洛尔等减慢心率。
有些病人合并有室性早搏和室房性早搏，会出现心悸、气短等症状，可以使用心律平、美西律等。中医中药如常用的参松养心胶囊、人参归脾丸、小柴胡颗粒、逍遥丸等，都可用于心脏神经官能症。
用药遵医嘱。