肛瘘手术住院天数与肛瘘的病情有很大的关系。肛瘘是一种感染性的疾病，保守治疗效果不明显，并且容易反复，一般需要手术根治。
通常单纯肛瘘和低位肛瘘，手术时间短，术后恢复效果好，住院时间在7天左右。对于高位肛瘘和复杂肛瘘，手术时间相对较长，术后恢复较慢，住院时间多在两周左右。
无论是单纯肛瘘还是复杂性肛瘘，若创面长好，完全恢复都要在一个月左右。建议患者术后定期消毒上药，促进创面愈合，严禁食用辛辣刺激性的食物，并保持大便通畅及肛周清洁，如有任何不适，应及时到医院进行处理。